Gospod Jezus Kristus je učence in apostole opozoril, da jih bodo v svetu preganjali. Teh dogodkov dolgo ni bilo pričakovati - že v drugi polovici prvega stoletja so rimske oblasti začele aktivno dejavnost, posvečeno preganjanju privržencev krščanske dogme.
Kristjani so začeli preganjati takoj po Kristusovem vnebovzetju. Ti dogodki so opisani v svetih spisih Nove zaveze. Glavni preganjalci so bili najprej Judje in šele nato rimske oblasti.
Prvi rimski cesar, ki je preganjal kristjane, je bil Neron. Bil je pobudnik požiga Rima, krivda pa je padla na Kristusove privržence. Kristjani so bili imenovani ne samo odpadniki iz poganske religije, temveč tudi škodljivi člani rimske družbe, zaradi katerih so nastale strašne posledice požara, ki je uničil več velikih rimskih območij. Tako so kristjani veljali za nasprotnike državnega in verskega sistema rimskega cesarstva.
Zgodovinsko gledano so bili kristjani pripisani drugim "grehom" proti družbi, poganstvu in avtoriteti. Tako so privrženci Kristusovih naukov videli strašne kanibale, ki naj bi se zbirali v jamah, da bi pili kri dojenčkov. Korenine tega prepričanja so v tem, da so kristjani iz prvih stoletij razumeli potrebo po zakramentu Kristusovega telesa in krvi. Prav tako so kristjani zamerili za različne osiromašene orgije, nerazumljive žrtve, ki so jih dali svojemu Bogu.
V času preganjanja kristjanov pod cesarjem Trajanom (98 - 117 let vladanja) se pojavlja nov razlog za preganjanje. Eden najbolj zastrašujočih in nerazložljivih. Tako imenovano preganjanje nomen ipsum, ki je prevedeno iz latinščine, pomeni "samo za ime". Dovolj je bilo, da se pokličete za kristjana. Pod cesarjem so obstajala določena telesa, ki so iskala kristjane z namenom kasnejših muk.
Eden glavnih razlogov za preganjanje je zavrnitev kristjanov, da bi žrtvovali daritve poganskim bogovom. Vsak rimski cesar-preganjalec je bil za to "zločin" upravičen usmrtiti. Zaradi tega so številni izjemni cerkveni voditelji prvih stoletij trpeli že pred smrtjo.
Preganjanje kristjanov v rimskem cesarstvu se je nadaljevalo v valovih, dokler krščanstvo ni postalo državna vera pod cesarjem Konstantinom Velikim (Milanski edikt iz leta 313 je bil glavni korak k poznejši tvorbi krščanstva kot državne religije Rima). Vendar je treba opozoriti, da so se tudi po Konstantinovem cesarjih pojavili cesarji, ki so lahko preganjali kristjane zaradi zavrnitve vrnitve na pogansko bogoslužje.