Prvi ruski car, ne iz klana Rurikovič, Boris Godunov, je umrl v starosti 53 let 13. aprila 1605. Njegova smrt je zapletena v skrivnosti in do danes zgodovinarji prepirajo, ali je bila njegova smrt naravna ali nasilna.
Anali dokumentov kažejo, da je Godunov na dan svoje smrti izgledal zdravo, se kopal z velikim apetitom in se povzpel na stolp, s katerega je rad raziskoval Moskvo. Potem se je spustil od nje, počutil se je slabo. Zdravnik, ki ga je poklical car, ni mogel storiti ničesar, caru je kri pritekla iz ušes in nosu, kmalu pa Godunova ni bilo več.
Kot je zapisal eden od predstavnikov angleškega veleposlanika Thomasa Smitha, ki je bil takrat na dvoru ruskega avtokrata, je car poleg občutka slabosti in bolečine v želodcu čutil in umrl še preden je zdravnik prišel.
Nenadna smrt Borisa Godunova, bolečine v želodcu dajo razlog za sum, da je bil kralj zastrupljen. Njegova smrt je bila koristna predvsem privržencem Lažnega Dmitrija I, čigar čete so se takrat približevale Moskvi.
Med ljudmi se je pojavila tudi govorica, da je bil sam kralj zastrupljen v obupu, ki ga je povzročila njegova nepriljubljenost med ljudmi, lakota v državi in okupacija Poljakov.
Poznavanje narave Borisa, njegovega značaja, želje po vrhovni oblasti, na kar je bil pripravljen na karkoli (obtožen je bil zastrupitve Ivana Groznega, umora Tsareviča Dmitrija, sina Ivana IV.) In kar je dosegel s tem, da je postal dejanski vladar Rusije pod Fedorjem Ivanovičem, lahko dvomite v različico Godunovega samomora. Rusko ljudstvo je bilo po njihovem mnenju carja najverjetneje ravnodušno do avtokrata. Napredovanje Poljakov po državi tudi kralja ni moglo prestrašiti, saj so bili v ruski zgodovini časi slabši, spomnite se na primer invazije mongolsko-tatarskih v Rusijo.
Ne smemo pozabiti, da je Godunov v zadnjem času pogosto bolan, njegova smrt pa je lahko posledica dolge bolezni avtokrata.
